牛病毒性腹泻病毒染料法qRT-PCR试剂盒
Bovine Viral Diarrhea Virus(BVDV)SYBR qRT-PCR Kit
产品介绍:
本公司以染料法qRT-PCR技术为基础开发了牛病毒性腹泻病毒(BVDV)的检测试剂盒,它具有下列特点:
1.一站式,用户不需要单独准备每种成分,只需要提供RNA样品。
2.基于染料法qRT-PCR检测,灵敏度比常规RT-PCR高10-100倍,可以达到100拷贝/反应。
3.根据牛病毒性腹泻病毒的保守序列设计引物,具有良好的特异性,不会跟其它生物的RNA发生交叉反应。
4.使用一管式qRT-PCR技术,RT和PCR两步在一管内完成,不需要中间转移样品,降低了操作误差和可能的污染。
5.本产品可用于定性检测,也可用于定量检测。定量检测时线性范围至少有5个数量级。
6.本产品足够50次20 μL体系的qRT-PCR反应。
本产品只能用于科研。。
产品组份:
2×SYBR qRT-PCR 缓冲液 500 μL
SYBR qRT-PCR酶混合液v2 50 μL
荧光PCR专用模板稀释液 1 mL
BVDV qRT-PCR引物干粉 50次
BVDV qRT-PCR
阳性对照(1E7拷贝/μL) 50 μL
使用手册 1份
注意:引物-探针干粉在使用前需要短暂离心,然后在离心管中加入110 μL的超纯水充分混匀后再使用,未用完的需要-20℃保存。
运输及保存:低温运输,-20℃保存,保存期限为12个月。阳性对照需要单独放置。
自备试剂: 样品RNA
使用方法:
一、稀释阳性对照(以1E1-1E6这6个10倍稀释度为例。由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行)。
1.标记6个离心管,分别为6、5、4、3、2、1。用带芯枪头分别加入45 μL荧光PCR专用模板稀释液,最好用带芯枪头(下同)。
2.换枪头,在6号管中加入5 μL 1E7拷贝/μL的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡1分钟,得1E6拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。
3.换枪头,在5号管中加入5 μL 1E6拷贝/μL的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡1分钟,得1E5拷贝/μL的阳性对照。放冰上待用。
4.重复上面的操作直到得到6个稀释度的阳性对照。放冰上待用。
二、样品RNA的制备
5.如果有N个样品,必须设置N+2个提取,多出的一个是PC(样品制备阳性对照),一个是NC(样品制备阴性对照)。可以用10 μL上步制备的阳性对照梯度稀释液中的第4号(浓度为1E4拷贝/μL,10 μL相当于1万拷贝)再加上一定量的水作为制备的阳性对照,加水后其总体积跟核酸纯化试剂盒所要求的起始样品体积一样。可以用水作为核酸制备的阴性对照NC。
6.用自选方法纯化N+2个样品的RNA,本试剂盒跟市场上大多数病毒样品RNA提取试剂盒兼容,也可以选购本公司的免提取核酸释放剂。
三、设置RT-PCR反应(20 μL体系,在样品制备室进行)
7.如果做定量分析并且只做1次重复,则标记N+9个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),6个用于标准曲线。如果做定性分析,并且只做1次重复,则标记N+4个PCR管,其中N+2个用于上步得到的N+2个样品,1个用于PCR阴性对照(用水做模板),1个用于PCR阳性对照(用第4步第4号管的阳性对照稀释液做模板)。下面只以定量分析为例描述操作步骤。
8.在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照,阳性对照样品要等所有管子盖上盖子后最后加):
成分 | N+2个 制备所得样品 | RT-PCR阴性对照 | RT-PCR 阳性对照(1-6管) |
2×SYBR qRT-PCR 缓冲液 | 10 μL | 10 μL | 各10 μL |
BVDV qRT-PCR 引物混合物 | 2 μL | 2 μL | 各2 μL |
N+2个RNA模板 | 7 μL | 不加 | 不加 |
自备超纯水 | 不加 | 7 μL | 不加 |
6个阳性对照稀释液 | 不加 | 不加 | 各7 μL(2号样到2号管,3号样到3号管…) |
SYBR qRT-PCR 酶混合液v2 | 1 μL | 1 μL | 1 μL |
上机后按下面参数进行RT-PCR(参数可能会因仪器不同而需优化)。
过程 | 温度 | 时间 |
RT(逆转录) | 50℃ | 30 min. |
预变性 | 95℃ | 2 min. |
RT-PCR反应 (45个循环) | 95℃ | 15 sec. |
60℃ | 15 sec.(采集SYBR通道的荧光信号) | |
72℃ | 15 sec. | |
按仪器预设程序进行溶解曲线分析 |
四、数据处理
10.通过溶解曲线分析排除无效数据。有Ct值,但Tm值跟阳性对照Tm不一样的样品结果,归为假阳性,此样本Ct数据无效,不予以分析。Tm跟阳性对照Tm一致的,为有效Ct。
11.如果两种阴性对照(样品制备阴性对照和PCR阴性对照)的溶解曲线所得Tm值跟阳性对照的Tm值一样,说明环境或试剂可能有过去的PCR扩增产物污染,则此次实验无效,需要解决污染问题再进行实验。如果两种阳性对照(样品制备阴性对照和PCR阴性对照)无Ct值则无效。
12.如果两种阴性对照(样品制备阴性对照和qRT-PCR阴性对照)是假阳性,有Ct但Tm与阳性样本不同,实验有效可以继续分析其它样品有效数据。
13.对定量检测,以阳性对照样品的浓度的log值为横轴,以有效Ct值为纵轴,绘制标准曲线。再以待测样品的有效Ct值从标准曲线上推算出样品RNA浓度的log值,再换算出待测样品的RNA浓度。
对定性检测,则有有效Ct值的为阳性,无有效Ct值的为阴性。