辣椒轻斑驳病毒探针法荧光定量RT-PCR试剂盒
产品及特点
本试剂盒可用于检测辣椒轻斑驳病毒。辣椒轻斑驳病毒属于帚状病毒科(Virgaviridae)
烟草花叶病毒属(Tobamovirus)的无包膜正单链 RNA 病毒。在电镜下,辣椒轻斑驳病毒呈
现为直杆状,长度约为 310±10 纳米,直径约为 18 纳米。自然条件下,辣椒轻斑驳病毒
主要侵染辣椒,未见其自然侵染其他植物的报道;人工接种可侵染茄科部分寄主,不能侵
染番茄。本产品是根据探针法荧光定量 RT-PCR 原理开发的辣椒轻斑驳病毒检测试剂盒,
它具有下列特点:
1. 即开即用,用户只需要提供样品 RNA 模板。
2. 引物等组分经过优化,灵敏度高。
3. 提供阳性对照,便于区分假阴性样品。
4. 特异性高,引物是根据辣椒轻斑驳病毒 RNA 序列高度保守区设计,不会跟其他
病毒的 RNA 发生交叉反应。
5. 既可用于定性检测,又可用于定量检测。用于定量检测时线性范围至少为 5 个数
量级。
6. 本产品足够 25 次 20μL 体系的探针法荧光定量 RT-PCR 反应。
7. 本产品只能用于科研。
产品组成 编号 规格
2 × OneStep Probe Mix 275 μL
OneStep Probe Enzyme Mix 25 μL
DEPC-H2O 500 μL
荧光模板稀释液 500 μL
辣椒轻斑驳病毒 RT-qPCR 引物-探针混合液 110 μL
辣椒轻斑驳病毒 RT-qPCR 阳性对照(1×10E8 拷贝/μL) 25 μL
使用方法
一、RNA 提取(样本制备区)
用自选方法提取纯化样品 RNA,本试剂盒跟市场上大多数核酸提取试剂盒兼容。建议使用病毒基因组 DNA/RNA 提取试剂盒提取 RNA。
二、稀释标准曲线样品(样本制备区)
(由于阳性对照浓度高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,避免污染样
品或本试剂盒的其他成分)。
1. 标记 6 个离心管,分别为 7,6,5,4,3,2。
2. 用带芯枪头分别加入 45 μL 荧光模板稀释液,(最好用带芯枪头,下同)。
3. 在 7 号管中加入 5 μL 1×10E8 拷贝/μL 的阳性对照(试剂盒提供),充分震荡 1 分钟,
得 1×10E7 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
4. 换枪头,在 6 号管中加入 5 μL 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡
1 分钟,得 1×10E6 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
5. 换枪头,在 5 号管中加入 5 μL 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得),充分震荡
1 分钟,得 1×10E5 拷贝/μL 的标准曲线样品。放冰上待用。
6. 重复上面的操作直到得到 6 个稀释度的标准曲线样品。放冰上待用。
若无需制作标准曲线,将阳性对照稀释到 1×10E5 拷贝/μL 即可。
结果分析
1. 如果制作标准曲线,则以阳性对照浓度的 log 值为横轴,以 Ct 值为纵轴,绘制标
准曲线。再以待测样品的 Ct 值从标准曲线上推算出样品 RNA 浓度的 log 值,推算出其浓
度。
2. 如果未制作标准曲线,按照如下标准判定结果:
阳性对照(1×10E5 拷贝/μL)结果:Ct 值<30,有明显指数增长,呈典型的 S 型曲线。
阴性对照结果:Ct 值>40 或无 Ct 值,无明显指数增长期和平台期。
样本检测结果:Ct 值<38,有明显指数增长,表明样本中检测出辣椒轻斑驳病毒,结
果为阳性;Ct 值>40 或无 Ct 值,表明样本中未检测出辣椒轻斑驳病毒,结果为阴性;Ct
值在 38-40 范围,应对样本进行复检,如重复实验结果 Ct 值仍在 38-40 范围,有明显指
数增长,则判定为阳性,否则为阴性。